Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN34H7C241 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN34H7C241 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms