Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DIRC3C9JPN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms