Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms