Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms