Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms