Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
RGPD3A6NKT7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms