Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCP1A6NGW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms