Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms