Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC5DA1L4H1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms