Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms