Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms