Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms