Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms