Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REXO2Q9Y3B8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REXO2Q9Y3B8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms