Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2IPQ9Y2D8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms