Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC4Q9Y296 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms