Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC2Q9Y235 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms