Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms