Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms