Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTF2Q9UNY4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms