Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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