Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms