Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKLN1Q9UL63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKLN1Q9UL63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms