Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms