Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms