Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD2Q9UKL4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms