Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms