Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms