Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA1Q9UIW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms