Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX20Q9UHI6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms