Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms