Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKX1-2Q9UD57 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms