Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms