Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms