Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GALPQ9UBC7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALPQ9UBC7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms