Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM27Q9P2N5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM27Q9P2N5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms