Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL42Q9P2K6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms