Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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