Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSRB1Q9NZV6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms