Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GDE1Q9NZC3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GDE1Q9NZC3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GDE1Q9NZC3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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