Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL2Q9NY43 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms