Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms