Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms