Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBNL3Q9NUK0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms