Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDS5BQ9NTI5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms