Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms