Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX1Q9NSU2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms