Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 LIG3-216ENST00000593099 4664 ntTSL 211□□□□□ -0.651e-12■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.2□□□□□ -1.261e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 MCCC2-208ENST00000512218 2127 ntTSL 217.74■□□□□ 0.439e-12■■■■■ 235.6
UTP3Q9NQZ2 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.339e-12■■■■■ 235.6
UTP3Q9NQZ2 MCCC2-206ENST00000509539 895 ntTSL 310.85□□□□□ -0.679e-12■■■■■ 235.6
UTP3Q9NQZ2 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.679e-12■■■■■ 235.6
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 57.63□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 235.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 520.36■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 235.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 235.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.217e-7■■■■■ 235.5
UTP3Q9NQZ2 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 235.5
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 235.4
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 235.4
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 235.2
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 224.12■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 221.54■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 218.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.17□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 517.14■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 235.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.341e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.311e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 517.59■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 514.71□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-213ENST00000469877 1501 ntTSL 213.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-218ENST00000491775 581 ntTSL 412.38□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF6-208ENST00000519136 816 ntTSL 516.33■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 234.7
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 224.04■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DENND6B-205ENST00000495607 2450 ntTSL 222.37■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-208ENST00000472257 3045 ntTSL 515.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 MPP6-204ENST00000426450 552 ntTSL 45.99□□□□□ -1.458e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-206ENST00000470895 922 ntTSL 321.81■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-209ENST00000483619 551 ntTSL 47.09□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 234.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 233.9
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 233.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-205ENST00000435926 3169 ntTSL 516.32■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 233.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 233.8
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 233.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-208ENST00000520972 2176 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 233.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 233.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-213ENST00000523711 3468 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 233.7
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-215ENST00000470535 586 ntTSL 212.77□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 233.5
UTP3Q9NQZ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-209ENST00000442555 3012 ntTSL 210.14□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 233.4
UTP3Q9NQZ2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 233.2
UTP3Q9NQZ2 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 233.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF841-204ENST00000594440 721 ntTSL 39.49□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 233.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF841-206ENST00000599430 389 ntTSL 29.26□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 233.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)27.24■■□□□ 1.953e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 525.77■■□□□ 1.723e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 217.11■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 233.1
UTP3Q9NQZ2 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.788e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 GCLC-203ENST00000504525 1011 ntTSL 323.99■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.918e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 BAHCC1-204ENST00000583828 591 ntTSL 320.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 ELK1-204ENST00000468956 769 ntTSL 519.67■□□□□ 0.748e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 FP565260.6-208ENST00000623810 781 ntTSL 518.97■□□□□ 0.638e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-211ENST00000475881 536 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.518e-12■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.58e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-207ENST00000441697 244 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.488e-12■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 FP565260.6-209ENST00000624714 807 ntTSL 217.89■□□□□ 0.458e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.288e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.188e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-204ENST00000424143 1605 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.158e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-208ENST00000450232 595 ntTSL 315.89■□□□□ 0.138e-12■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-22■■■■■ 232.9
UTP3Q9NQZ2 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt15.64■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 232.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 509.9 ms