Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms