Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms